但武王入城，以亿万大周子民为要挟，夺走其圣龙气运。武王夺圣龙气运赐予其子与女，自此大武有龙凤相护，国运鼎盛。
圣龙根被破，天生八脉消退，修行之路艰难。进入祖地，遇见苍渊和夭夭。在苍渊的帮助下解决了八脉不显的问题。拜苍渊为师，得授龙吸术、混沌神磨观想法以及天元笔。
之后带夭夭和吞吞离开祖地。日夜刻苦修炼，在大考中击败林枫等人进入甲院。于玉灵瀑中修炼打通第三、四脉。在与齐王次子齐岳的玉灵瀑之斗中取得胜利。在黑林山脉中历练，使用三十六兽开脉纹打通第五、六脉。历练时遭到齐岳的暗算，却意外收获齐王府顶尖源术之一的下品玄源术――玄芒术。在府试中击败齐岳并断其一臂。
前往沧澜郡，与齐王长子齐昊发生碰撞，并略胜一筹。帮助大将军卫沧澜解决其子瘴魔毒的问题，从而拉拢卫沧澜助其夺玉婴果和四品源食“火灵穗”。进入养气境时，体内的怨龙毒与金色气府相融，变成了闻所未闻的血红气府，源气中也融入了怨龙毒变成了毒龙气，但融入了怨龙毒的源气变得更为的凶猛。
在一番争斗下，最终夺得两枚玉婴果和一枚银色指环。在深谷中，黑毒王战卫沧澜，齐昊战周元。周元凭借血红气府以及金猿搬山纹才能与齐昊正面硬碰，并开启天元笔第二道源纹“侵蚀”斩杀齐昊，得到了四品源食“火灵穗”。吞吞击败巨蟒战傀，得到四品蟒属兽魂。吞吞与卫沧澜联手击败黑毒王，黑毒王为保住性命，被夭夭刻下锁神子母纹，臣服于大周皇室。
在夭夭强大的神魂感知下，找到战傀宗的地宫，发现了上万正处于休眠状态的无主战傀，并得到了天源兵“阳冥剑“和变形战甲“银影“。回到大周城后，齐王叛乱建立大齐王朝并向大周下战书。成功修成祖龙经第一重――通天玄蟒气。
齐王等七大太初境强者围城。周元、苏幼微各击杀一位太初境强者后，吞吞联手周元击败一位太初境强者，并将其吞噬。周擎打破了心中阴影，实力恢复到了太初五重天，击败武王金影，并斩杀齐王等叛贼。周元因消耗太大而昏迷了一个月，苏醒后进入了养气境中期。
苏幼微因善良而获得自己的缘法：一位灰袍老人要收她为徒。苏幼微和爷爷随老人离开。
周元与夭夭、吞吞离开大周，前往圣迹之地。来到古境，在“珍宝阁”遇到了万兽王朝的绿萝和古家的古翎。并从古翎手中获得进入古家炼魂塔的名额。与绿萝一同进入古家的“吞魂塔”，发现古家的秘密，遭遇战斗。周元独战天关境中期的古翎。修成龙碑手第三重――破天，击杀古翎并带走吞魂塔内的黑色水晶球――圣魂晶。周元、夭夭等全身而退离开古家，并取出了圣魂晶内的神魂本源。
途中遇到了剑王朝的剑瞎子，稍作停留，前往圣迹城。